Предоставление пассажирам и клиентам услуг высокого качества, отвечающих принятым международным стандартам, создание благоприятной атмосферы и привлекательности Главных воздушных ворот Сахалина для российских и зарубежных компаний — основные задачи Федерального государственного унитарного предприятия «Аэропорт Южно-Сахалинск».
История аэропорта «Южно-Сахалинск» началась в 1945 году. После освобождения Южного Сахалина и Курильских островов от японских милитаристов гражданская авиация Сахалинской области получила новое развитие. С октября 1945 года на военный аэродром «Осава», расположенный западнее пос. Большая Елань, из Хабаровска в Южно-Сахалинск открылись регулярные полеты. В двухэтажном деревянном здании японской постройки разместилась первая авиационная администрация Сахалинской области. Дальневосточное управление ГВФ направило старшего лейтенанта Полозова (назначен начальником аэропорта) и капитана Бичуна — командира 198-го летного отряда, состоящего из 5 экипажей, группы технического состава инженерно-авиационной службы, двух самолетов ЛИ-2, и одного «Дугласа» СИ-47, для организации на базе военного аэродрома авиатранспортного предприятия. Первым начальником аэропорта стал Полозов К.И. Спустя время, в мае 1946 года в Южно-Сахалинский аэропорт был направлен пилот Лосенков с самолетом ПО-2. В течение года он осуществлял патрулирование лесов Сахалина для борьбы с пожарами и использовался в других, в основном хозяйственных целях. Для организации авиаперевозок была открыта билетная касса, созданы линейно-эксплуатационная ремонтная мастерская самолетов и служба ГСМ. Это явилось началом развития инфраструктуры аэропорта Южно-Сахалинска.
В сентябре 1947 г. произошло объединение аэропорта "Южно-Сахалинск" и 198-го летного отряда. В состав Южно-Сахалинского объединенного авиаотряда ДВТУ ГВФ были включены все действующие аэропорты и посадочные площадки Сахалинской области. К этому времени руководство аэропорта поменялось, на смену Полозову пришел Лавров Иван Семенович, который руководил предприятием с 1947 г. до июля 1950 года. На базе аэропорта создан 38-й авиатранспортный отряд. Командиром отряда назначен Приходовский Михаил Иосифович, бывший командир звена самолетов Ли-2, Ил-12.
В 1950 году 38-й авиатранспортный отряд был реорганизован и на его основе создано 24-е авиатранспортное звено. Именно летчики 24-го звена проложили первую воздушную трассу на Курильские острова. В 1955 году происходит объединение летного парка Александровск-Сахалинского и Южно-Сахалинска, так произошло формирование 147-го объединенного авиаотряда с базой в Южно-Сахалинске. Командиром авиаотряда стал Алексашин Михаил Иванович. Перед отрядом поставили задачу: обеспечение растущих нужд населения, то есть увеличение пассажирских перевозок и оказание помощи народному хозяйству области. Во второй половине 50 гг. авиаотряд значительно укрепляет свою материальную базу, в его распоряжение поступают самолеты ИЛ-14, которые теперь совершают регулярные рейсы в Хабаровск, Оху, Кировское и т.д. и вертолеты МИ-1 и МИ-4. Руководил предприятием с 1956 по 1961 год Стрелин Владимир Яковлевич. Помимо пассажирских перевозок, авиаотряд оказывал большую помощь рыбакам в поисках рыбных косяков, патрулировании лесов, выполнении срочных санитарных заданий, переброске геологических партий, доставке грузов и оборудования. В августе 1963 года 147-й авиаотряд реорганизуется в Южно-Сахалинский ОАО. Предприятие возглавил Лешуков Юрий Александрович. Важной вехой в развитии авиации на дальнем Востоке стал 1964 год. Был введен в строй новый Хомутовский аэродром, который стал основной базой Южно-Сахалинского ОАО.
Новый аэропорт получил возможность принимать более современные самолеты АН-10 и ИЛ-18, что значительно сократило время полета на материк. С 1971 по 1985 год руководство объединенным авиаотрядом осуществлял Гольцев Вячеслав Михайлович. Авиапарк предприятия на этом этапе включал в себя самолеты АН-2 и АН-24, ИЛ-14, вертолеты МИ-1, МИ-2, МИ-4 и МИ-8. В 1985 г. была реконструирована взлетная полоса для приема самолетов ТУ-154, совершенствовались технологические процессы, качество обслуживания. Построены новые взлетные полосы в городах Оха, Южно-Курильск, реконструирована полоса в аэропорту Зональное. Пассажирские перевозки были особой гордостью авиаторов. Помимо внутренних рейсов аэропорт «Южно-Сахалинск» осуществлял перевозки во многие города страны: Москва, Хабаровск, Владивосток, Благовещенск, Комсомольск-на-Амуре. С апреля 1985 по 1995 год командиром Сахалинского ОАО являлся Королев Анатолий Александрович. Особым для аэропорта «Южно-Сахалинск» стал 1990 год. Министерство гражданской Авиации СССР приняло решение об открытии аэропорта для международных полетов. Обладая всем необходимым для приема и качественного обслуживания воздушных судов и авиакомпаний, предприятие очень быстро освоило это новое для себя направление. В 1993 году аэропорт «Южно-Сахалинск» выделился из состава объединенного авиационного отряда. С 2001 года руководителем аэропорта стал Лобкин Андрей Игоревич, приглашенный в 2003 г. на должность генерального директора ОАО «Аэропорт Толмачево».
В настоящее время директором ФГУП «Аэропорт Южно-Сахалинск» является Самойлов Антон Павлович.
Главная задача аэропорта сегодня — привлечение наибольшего числа авиакомпаний, качественное и надежное выполнение технологических процессов и обеспечение наибольшего комфорта и безопасности пассажиров. К услугам пассажиров международных линий открытый в 1998 году и обновленный позднее международный сектор, отвечающий всем мировым стандартам. На предприятии трудится без малого 600 человек, которые обеспечивают прием и обслуживание воздушных судов таких авиакомпаний, как "Сахалинские авиатрассы", "Аэрофлот", "Трансаэро", "S7", "Владивосток Авиа", "Asiana","Авиашельф", "Амурские авиалинии". На сегодняшний день из аэропорта «Южно-Сахалинск» осуществляются полеты по 10-ти внутренним и 5-ти международным направлениям.
В планах авиакомпаний-партнеров — увеличение еженедельной частоты рейсов на популярных направлениях, изменение типов воздушных судов, для удобства транзитных пассажиров — времени вылета, отдыхающих — введение новых международных рейсов.
В 2009 году в островной аэропорт прибыли 312 978 пассажиров, из них на международных рейсах — 42 982 человек; вылетели 317 336 пассажиров, из них на международных рейсах — 44 528 человек. Всего обработано груза и почты в 2009 году 98,3% (от объема 2008 года).
В 2010 году в островной аэропорт прибыло 372 665 пассажиров, из них на международных рейсах — 47 534 человека; вылетел 373 021 пассажир, из них на международных рейсах — 49 150 человек. В итоге, в 2010 году (по сравнению с 2009 годом) в аэропорту «Южно-Сахалинск» общий пассажиропоток увеличился на 18% (общее количество обслуженных пассажиров — 745 686); общий тоннаж самолетовылетов увеличился на 13,5%. Всего обработано груза и почты в 2010 году 100,7% (от объема 2009 года).
На сегодняшний день международный аэропорт «Южно-Сахалинск» может принимать такие типы воздушных судов, как ЯК-40, Як-42, Ан-24РВ, Ан-26, Ан-72, Ан-74, АН-12, ТУ-134, ТУ-154М, ТУ-204, ТУ-214, Ил-76, ИЛ-62М, Ил-86, Ил-96-300, DASH 8-200, DASH 8-300, Боинг 737-200, Боинг 737-500, Боинг 757-200, Боинг 767-300ER, А-319, А-320, А-321, А-310-200, А-310-300, самолетов деловой авиации типа FALCON-200, FALCON-900, GULFSTEAM-IV SP, вертолетов Ми-8 МТВ, Ми-8АМТ, Ми-26 и классом ниже. Летом 2009 года южно-сахалинский аэропорт распоряжением Росавиации допущен к приему Б-777-200, А-330 и его модификаций.
Осень 2010 года отмечена знаменательным событием для главного островного аэропорта — в аэропорту «Южно-Сахалинск» впервые произвел посадку тяжелый транспортный самолет АН-124–100 «Руслан» авиакомпании «Волга-Днепр».
Жесткое исполнение правил авиационной безопасности и требований безопасности полетов, соблюдение норм международных стандартов, создание условий перспективного развития предприятия — главные стратегические цели ФГУП «Аэропорт Южно-Сахалинск». За последнее время удалось стабилизировать работу предприятия. Предприятие продолжает реализовывать утвержденную до 2024 года программу по переоснащению парка снегоуборочной техники, что позволяет перейти на новые, более прогрессивные методы зимнего содержания аэродрома, а также уменьшает время ликвидации последствий стихий, которыми славится Сахалин. На предприятии работает квалифицированный персонал постоянного состава, который осуществляет эксплуатацию, технический осмотр, ремонт как уже имеющихся аэродромных уборочных машин, так и новой приобретаемой техники. Для возможности обслуживания современных типов самолетов покупается качественная дорогостоящая перронная спецтехника.